Eine riesige Anomalie verwüstete das japanische Festland und zerstörte den größten Teil Tokios, wodurch drei Viertel der Stadt in den Ozean versanken.
Zehn Jahre später wechselt die Erzählung zu Ganta Igarashi, einem scheinbar durchschnittlichen Schüler, der die Mittelschule der Präfektur Nagano besucht. Als Flüchtling, ein Überlebender des fantastischen Bebens, hat Ganta ein normales Leben geführt und keine Erinnerungen an die Katastrophe. Dies alles ändert sich, als ein seltsamer Mann mit rubinroter Rüstung und Blut durch seine Klassenzimmerfenster schwebt. Wahnsinnig grinsend massakriert der 'Rote Mann' die ganze Klasse von Ganta, aber anstatt ihn zu töten, bettet er eine rötliche Kristallscherbe in den Torso von Ganta ein. Innerhalb weniger Tage nach dem Massaker wird Ganta im Deadman Wonderland zum Tode verurteilt, einem Gefängnis, das gleichzeitig als Themenpark dient und als Angeklagter einem Känguru-Gerichtssaal unterworfen ist.
Als Ganta im Gefängnis ankommt, wird er mit einer einzigartigen Erfassung ausgestattet, die wichtige Indikatoren und seinen Platz verfolgt. Ein tödliches Toxin wird durch den Greifer kontinuierlich in seinen Blutkreislauf injiziert, kann jedoch neutralisiert werden, indem alle drei Male ein bestimmtes süßes Medikament eingenommen wird, das häufig durch verschiedene Aktionen im Gefängnis, dh durch Auftritte für Menschenmengen, eingenommen wird Um hinter den Kulissen zu operieren, mit gefälschten Faktoren zu kaufen (eine Art Geld unter Gefangenen im Deadman Wonderland) usw. Um Cast Points zu sammeln, muss ein Täter die tödlichen Spiele der Einrichtung ausführen und leben. Zum Glück für Ganta hilft ihm eine mysteriöse Frau namens Shiro, die Ganta scheinbar versteht und gleichzeitig von anderen Gefangenen verstanden wird.
Während Ganta als Täter in der Todeszelle leben will, will er den 'Roten Mann' ausfindig machen, um seinen Titel zu klären. In einer seltsamen Wendung beginnt Ganta, die Fähigkeit zu erlangen, sein Blut zu kontrollieren und es zu einer Waffe für die Idee zu machen. Unbekannt für Ganta ist er einer der „Toten“ des Gefängnisses. Eine isolierte Anzahl von Gefangenen hat die Zweige der Sünde, die sie in die Lage versetzen, ihr Blut zu kontrollieren. Ganta muss an grausamen Gladiatoren-Deathmatches namens Carnival Corpse teilnehmen, deren anonyme Zuschauer beträchtliche Geldbeträge zahlen, um zu beobachten, nachdem seine Fähigkeiten gefunden wurden. In seinem langen Kampf ums Leben gelingt es ihm, sich mit einigen von denen anzufreunden, gegen die er im Stadion gekämpft hat, und mit ihrer Hilfe setzt Ganta seine Suche fort, um die Identifizierung des 'Roten Mannes' zu finden, warum er sich in einen Toten verwandelt hat. sowie die schattigen Geheimnisse, die die Strafvollzugsbehörden verbergen
